Fundacja Zeggerteum stanowi w sensie prawnym instytucję w pełni niezależną i odrębną od parafii św. Krzysztofa. Jej cele statutowe zostały wyznaczone przede wszystkim w zakresie pielęgnowania dziedzictwa kulturowego parafii, a także kreowania środowiska dla nowych działań artystycznych. Największym i najważniejszym projektem prowadzonym przez Fundację jest budowa nowych organów w kościele św. Krzysztofa.